A Igreja Ortodoxa Universal é composta, atualmente, pelas seguintes Igrejas, autogovernadas ou autocéfalas, universalmente reconhecidas:
- Patriarcado de Constantinopla
- Patriarcado de Alexandria e toda a África
- Patriarcado de Antioquia e todo o Oriente
- Patriarcado de Jerusalém
- Patriarcado de Moscovo e toda a Rússia
- Patriarcado da Geórgia
- Patriarcado da Sérvia
- Patriarcado da Roménia
- Patriarcado da Bulgária
- Igreja de Chipre
- Igreja da Grécia
- Igreja da Polónia
- Igreja da Albânia
- Igreja Checa e Eslovaca
Existem ainda várias outras Igrejas que, apesar de autogovernadas, não atingiram a total independência e, por essa razão, são denominadas autónomas, não autocéfalas. São elas:
- Igreja da Finlândia (Patriarcado de Constantinopla);
- Igreja do Monte Sinai (Patriarcado de Jerusalém);
- Igreja Americana – OCA (quase autocéfala, mas reconhecida somente como parte do Patriarcado de Moscovo);
- Igreja da Ucrânia (Patriarcado de Moscovo);
- Igreja da Moldávia (Patriarcado de Moscovo);
- Igreja da Japão (Patriarcado de Moscovo);
- Igreja da China (Patriarcado de Moscovo).